系统优化、清理与故障修复

内容列表

系统优化
    优化启动速度
系统清理
    清理残余软件
    删除孤立软件
    删除没用的系统内核
    隐藏桌面图标  
故障修复
   修复用户密码
   软件列表错误
   修复软件仓库错误
      sudo：set suid root？
   $home无法写入？
   /etc/sudoers Is mode 0662？
   修复启动菜单
   Live CD/DVD出现“out of rage”
   使用windows bootloader来启动BioInfoServ系统
   Gtk-WARNING **: 无法在模块路径中找到主题引擎：“pixmap”？
   无法挂在移动磁盘设备？

系统优化

系统优化包含较多的内容，如启动速度优化、硬盘读取优化等，系统启动优化可以采用sysv-rc-conf来进行，也可以采用图形界面的boot-manager来进行：

采用sysv-rc-conf优化启动速度

sysv-rc-conf是一个终端下配置工具（如何安装，请见第11章 添加、删除、更新软件）如下图：

具体操作时，采用空格键来选取或者剔出，用左右间进行光标移动，h为帮助快捷键，采用q键退出配置界面。 至于系统中每个服务的具体内容是什么，您可以参考/etc/rc*.d中的启动脚本或系统服务。

[Warning]
注意：每个程序都有一定的运行等级，如S、、1、2、3、4、5等，它们的含义如下：

等级S：开机进程中的第一运行等级，它将调度/etc/init.d/rcS中的脚本，从而执行/etc/rcS.d目录下的所有进程。
等级 1：单用户模式，执行/etc/rc1.d目录下的所有进程。
等级 2，3，4，5：分别执行/etc/rc2.d、/etc/rc3.d、/etc/rc4.d和/etc/rc5.d中的所有进程。这种等级适合多用户环境。

/etc/rc*.d中的系统服务可参下列说明，自行进行关闭或开启：

acpi-support：高级电源管理支持。（若需管理电源，必不可少。对笔记本电脑很重要）
acpid：电源管理守护程序。（若需管理电源，必不可少。对笔记本电脑很重要）
alsa：声卡驱动程序，包括了asla和其他声卡驱动。（如需系统发声，必不可少）
alsa-utils：声卡测试及设置等相关工具。（如需系统发声，必不可少）
anacron：用于系统计划任务安排或自动化作业配置工具。（如果需设置自动执行任务，必不可少）
apmd：电源管理工具。（若需管理电源，必不可少。对笔记本电脑很重要）
apparmor：类似selinux的应用程序访问控制系统，即控制程序对其他文件和设备的访问。
apport：应用程序崩溃报告读取处理工具。
atd：任务调度系统，在系统负载最低的时候执行批量任务。（如果需批处理任务，必不可少）
aumix：音量调节工具。
binfmt-support：核心支持其他二进制的文件格式（如一些.bin格式软件）。（建议开启 ）
blutooth：蓝牙驱动。
bluez-utiles：蓝牙设备工具。
bootlogd：系统日志管理。（最好开启）
console-setup：终端字体和键盘设置。
cron：定时任务执行工具。
cups：打印机驱动及管理。
dbus： 前端总线和内存总线信息通讯系统，主要管理管道、内存、消息队列、信号量及socket等。（非常重要）
dns-clean：拨号上网时用于DNS的自动获取和清理。
evms：企业级存储设备系统管理工具——企业卷管理器（了解它）。
fetchmail：邮件接受守护程序。
gdm：gnome桌面登录及管理器。
gdomap：分布式程序管理守护程序。
gpm：终端程序运行时的鼠标支持服务。
hal：硬件抽象层接口，用于智能化管理新设备连接及其连接方式。（如果经常驳接新设备，建议开启）
halt：记录系统开机信息，执行快速关机的服务。与shutdown、poweroff、reboot、init等命令具有同等级别的功能。（不关闭)
hdparm：IDE硬盘参数优化工具，配置文件为 /etc/hdparm.conf。
hibernate：系统休眠功能。
hotkey-setup：笔记本电脑（HP、Acer、ASUS、Sony、Dell和IBM）功能键支持工具。
hotplug and hotplug-net：硬件热插拔支持。
hplip：HP打印机和图形子系统
ifrename：网络接口重命名工具脚本，适合多网卡。
inetd：网络守护程序，管理入网连接。配置文件在/etc/inetd.conf 中。
killprocs：杀死进程的服务。
klogd：内核消息和系统消息优先级划分与处理。（非常重要）
linux-restricted-modules-common：系统受限模块支持。
lvm：逻辑卷管理器。与企业卷管理器有较大区别。
makedev：创建设备文件到/dev/，用户程序和硬件交互。（非常重要）
mdamd：管理、监视磁盘阵列服务。
module-init-tools：从/etc/modules加载扩展模块，建议开启。
networking：网络接口和DNS扫描管理，依照/etc/network/interfaces 文件预设激活网络。（非常重要 ）
network-manager：网络管理工具。
ntpdate：时间同步服务。
pcmcia：pcmcia卡（个人电脑存储卡）设备支持服务，主要存在于笔记本电脑上的。
Portmap：RPC端口映射器——将RPC（远程过程调用，包含NIF和NIS服务）程序号转化为DARPA协议端口的服务。
powernowd：CPU频率动态调节（用于节能支持）。
ppp and ppp-dns：ADSL拨号连接工具。
rc.local：系统开机启动程序配置。
readahead：程序和库文件预加载服务（用于加快程序的启动）。
reboot：系统重启服务。（非常重要）
resolvconf：自动配置DNS的服务。
rmnologin：nologin是用户阻止非根用户登录系统，而rmnologin则允许用户登录。通常是在某个程序启动后执行的动作，删除nologin，即可登录系统。（非常重要）
rsync：客户端和服务端同步守护程序。
sendsigs：在重启和关机期间发送信号。（非常重要）
single：激活单用户模式
ssh：远程安全登录服务守护程序。
stop-bootlogd：在2，3，4，5运行级别中停止bootlogd服务
sudo：检查sudo状态。
sysklogd：系统日志。
udev & udev-mab：用户空间dev文件系统。（非常重要）
umountfs：卸载文件系统
urandom：随机数生成器
usplash：开机画面支持服务。
vbesave：显卡BIOS配置工具。保存显卡的状态
xorg-common：设置X服务ICE socket。
adjtimex：调整核心时钟的工具
dirmngr：证书列表管理工具,和gnupg一起工作。
hwtools：一套低级硬件管理优化工具。
libpam-devperm：系统崩溃之后，用于修复设备文件的守护程序。
lm-sensors：板载传感器支持
mdadm-raid：磁盘阵列管理器
screen-cleanup：清除开机屏幕的脚本
xinetd：用以替代inted的超级网络守护程序。

系统清理

1. 残余软件清理

系统在安装后，有些文件会残留在系统里，这时就需要清理这些无用的东西。
打开sysnaptic，点击右下角的“状态”栏，删除其中 Residual Config package（未安装的残存配置）文件，如下图：

清理/var/cache/apt中已经安装但保留在硬盘上的临时软件包：
sudo apt-get autoclean

sudo apt-get clean

使用localepurge删除不用的多语言支持：
首先安装localepurge， sudo apt-get install localepurge, 会弹出语言选择面板， 选择您所需要的语言。

2. 删除孤立的库文件

采用deborphan进行孤立库文件的删除，首先查询孤立的sudo deborphan，随后删除残余库文件：
sudo deborphan | xargs sudo apt-get -y remove purge

此外，您还可以利用gtkorpha这个图形端软件来进行清理工作：

3.清除旧有的内核

首先采用命令dpkg –get-selections|grep linux查看系统中具有那些旧有的内核:
libselinux1 install
linux-386 install
linux-image-2.6.15-23-386 install
linux-image-2.6.15-27-386 install
linux-image-2.6.15-27-686 install
linux-image-2.6.15-28-386 install
linux-image-2.6.15-28-686 deinstall
linux-image-386 install
linux-kernel-headers install
linux-restricted-modules-2.6.15-23-386 install
linux-restricted-modules-2.6.15-27-386 install
linux-restricted-modules-2.6.15-27-686 install
linux-restricted-modules-2.6.15-28-386 install
linux-restricted-modules-2.6.15-28-686 deinstall
linux-restricted-modules-386 install
linux-restricted-modules-common install
linux-sound-base install
util-linux install

例如上面具有linux-image-2.6.15-23-386旧内核，卸载命令为：
sudo apt-get remove linux-image-2.6.15-23-386
可以实现自动删除内核文件了，还可以释放磁盘空间。

删除完毕，您可以查看当前系统正在使用的内核：
uname -a
使用这个命令可以查看当前系统使用的内核。

4.隐藏桌面图标

修改或新建~/.config/xfce4/desktop/xfdesktoprc
找到或添加
[file-icons]
show-filesystem=true
show-home=true
show-trash=true
show-removable=true
改true为false可以隐藏相应图标

系统故障修复

1）恢复Grub菜单

下面这个方法适合旧版的BioInfoServ：

由于某些原因导致系统多重启动菜单不能正常引导系统，这时您可以采用以下办法进行
*. 首先用 BioInfoServOS Live DVD启动系统;
*. 打开终端窗口，执行 sudo grub 进入 Grub 命令行;
*. 确定 /boot 的位置，执行 find /boot/grub/stage1后，会出现类似 (hd0,N)字样的结果，后面的命令里使用您机器上得到的结果， 这儿假定是 (hd0,2)(这一步是为了确定您的 /boot 的位置，如果您知道在哪儿， 那么跳过这步);
*. 执行命令： root (hd0,2)
（注意要换成您机器上的实际位置,如果觉得无法确定,那么采用您还可采用后面的方法来探测。
*. 执行命令 setup (hd0);
*. 执行命令：quit
退出，完成了.
如何探测您系统的启动位置？
正常情况下grub会修改/boot/grub/menu.lst，添加相应的系统启动项，如添加一个 Windows 的 Grub 项，语句为
title Windows
root (hd0,0)
chainloader +2
boot
如果这个启动项设置错误，启动的时候会会自动弹回到初始的菜单选择状态，要修正这额错误，我们可以采用以下的方式进行探测修改。
采 用上下键，选中windows菜单，然后按e，进入编辑状态，此时，您可以修改root(hd0, 0), 换一个数字，然后回车到启动菜单，再选中windows，按b，启动windows，如果能启动，说明修改正确，如果不行，那么按照上面的方式再修改 (hd0, 0)中数字，如修改为(hd0, 1),， 直到启动正常BioInfoServOS系统为止。只要能启动到BioinfoServOS系统下，我们就在BioInfoServOS系统下，将 menu.lst修改保存。

  1. 用 BioInfoServOS Live CD 启动

  2. 打 开终端窗口，执行 sudo grub 进入 Grub 命令行

  3. 确 定 /boot 的位置，执行 

    find /boot/grub/stage1

    会 出现类似 (hd0,N)字样的结果，后面的命令里使用您机器上得到的结果， 这儿假定是 (hd0,2)
    (这一步是为了确定您的 /boot 的位置，如果您知道在哪儿， 那么跳过这步) 

  4. root (hd0,2)

    （注 意要换成您机器上的实际位置,如果觉得无法确定, 那么采用"添加Grub菜单项" 所提及的方法.

  5. setup (hd0)
  6. quit

    退 出，完成了

  7. 如何探测您系统的启动位置？
    正常情况下grub会修改/boot/grub/menu.lst，添加相应的系统启动项，如添加一个 Windows 的 Grub 项，语句为
    title Windows
    root (hd0,0)
    chainloader +2
    boot
    如果这个启动项设置错误，启动的时候会会自动弹回到初始的菜单选择状态，要修正这额错误，我们可以采用以下的方式进行探测修改。
    采 用上下键，选中windows菜单，然后按e，进入编辑状态，此时，您可以修改root(hd0, 0), 换一个数字，然后回车到启动菜单，再选中windows，按b，启动windows，如果能启动，说明修改正确，如果不行，那么按照上面的方式再修改 (hd0, 0)中数字，如修改为(hd0, 1),， 直到启动正常BioInfoServOS系统为止。只要能启动到BioinfoServOS系统下，我们就在BioInfoServOS系统下，将 menu.lst修改保存。

    新版BioInfoServ 4.0系统，其grub程序有了较大改变，上面的方法也需相应调整：

    由于BioInfoServ4.0和Ubuntu 10.04系统在grub版本进行了全新更新，因此，方法1不再合适。因此，需要如下进行：

    *. 首先用 BioInfoServOS 4 Live CD启动系统;

    *. 打开终端窗口，执行sudo fdisk -l，查看硬盘分区情况，示例如下：

       Device Boot      Start         End      Blocks   Id  System
    /dev/sda1   *           1        2244    18024898+   7  HPFS/NTFS
    /dev/sda2            2245        2372     1028160   82  Linux swap / Solaris
    /dev/sda3            2373        4410    16370235   83  Linux
    /dev/sda4            4411       19457   120864997    5  Extended
    /dev/sda5            4411        4794     3084448+  83  Linux
    /dev/sda6            4795        9588    38507773+   7  HPFS/NTFS
    /dev/sda7            9589       14381    38499741    7  HPFS/NTFS
    /dev/sda8           14382       19457    40772938+   7  HPFS/NTFS

    在上述分区中，BioInfoServ 4主要安装在sda3分区中，故先将BioInfoServ 4安装分区挂在到/mnt目录中：

    *.挂在BioInfoServ 4安装分区，执行命令：sudo mount /dev/sda3 /mnt

    *. 安装grub，执行：sudo grub-install --root-directory=/mnt /dev/sda

    此时，信息反馈如下：

    Installing GRUB to /dev/sda as (hd0)...
    Installation finished. No error reported.

    看到无安装错误提示（ Installation finished.No Error Reported），说明安装成功，可退出重启系统。

    http://packages.ubuntu.com/dapper/ms-sys

    sudo fdisk -l

    sudo ms-sys -m /dev/sda

2）Live CD/DVD光盘启动出现”out of range”错误

如果Live CD/DVD在运行启动过程中出现“out of range”的提示，出现这个问题可如下解决：

A. 当出现”out of range”的时候，可以使用ctrl+alt+F1切换到终端界面;

B. 采用命令sudo nano /etc/X11/Xorg.conf编辑该文档,找到如下文字:
…
Monitor “Generic Monitor”
DefaultDepth 24
….
SubSection “Display”
Depth 24
Modes “1024×768″
EndSubSection
EndSection

修改Modes “1024×768″为您显示器所对应的分辨率。然后crtl+x，按y，保存退出。

C. 采用命令sudo ps -A all列出所有进程，记下tty1-tty7的进程号;

D. 采用命令sudo kill 进程号,结束所有tty1-tty7。

如果您幸运的话，执行这个命令后，光盘系统会自动重新加载显示驱动，并正常加载图形登录界面，否 则，您需要反复多次执行sudo ps -A all， sudo kill 进程号 才能导致桌面正常加载到图形界面。

3）出现sudo: set suid root的修复方法

有时候由于升级或者其他莫名的原因，会出现 sudo：set suid root。这时，你会发现不能执行sudo。实质上出现这个的原因时sudo被错误修改了执行权限，而不能被执行。
修复的方法如下：
重新启动系统到安全模式，执行如下命令：
chown root:root /usr/bin/sudo
chmod 4111 -R /usr/bin/sudo
然后在启动到正常模式下，您发现一切恢复正常。

4）出现出现提示$home/.dmrc无法写入，权限应为644之类的情况的修复办法
如果采用ls -al ~/.dmrc发现该文件不属于您当前使用的用户名，或者权限不为644（即-rw-r–r–）。当然如果是您 当前用户名的目 录，应该为drwxr-xr-x (755)，权限和群组设置上已经出现了问题，您需要按照以下操作进行修改：
sudo chown -R biowee:biowee /home/biowee
sudo chmod 644 /home/biowee/.dmrc
sudo chown biowee:biowee /home/biowee/.dmrc
注意：此处的biowee实际应对应您home用户目录。

5）修复/etc/sudoers Is mode 0662, should be 0440问题

先将系统启动到安全模式下，然后采用以下命令来进行：
chown root:root /etc/sudoers
chmod 0440 -R /etc/sudoers

6）如何利用windows系统的boot loader来引导BioInfoServ系统？

先启动进入live cd光盘桌面（有些发行版本直接在系统下就可创建，并不需要live cd），然后采用如下命令得到一个linux引导文件：
如果你是IDE硬盘，则
dd if=/dev/hda of=/media/linux.bin
如果是sata
dd if=/dev/sda of=/media/linux.bin
随后，将linux.bin 复制到Win引导分区（假定在sda1分区上）
sudo cp linux.bin /media/sda1
然后回到windowsxp,修改boot.ini，添加
C:\linux.bin=”BioInfoServ OS” 保存后重新启动，可以看见，BioInfoServ OS由windows xp的启动菜单启动了。

7）正在读取软件列表..错误？

你可能会发现在apt-get update结束时发现以下错误信息：
正在读取软件包列表… 有错误!
E: Problem parsing dependency Depends
E: 处理 bmp-wma (NewVersion1)时出错
E: Problem with MergeList
/var/lib/apt/lists/ubuntu.cn99.com_ubuntu-cn_dists_edgy_main_binary-i386_Packages
E: 无法解析或打开软件包的列表或是状态文件。
出 现这个问题，实际上是软件仓库发生了问题，除非buntu-cn本身应进行修正，否则无法处理（不过目前看来这个仓库是正常的）。如果您出现这样类似的错 误，您可以在/etc/apt/sources.list中将ubuntu-cn字段资源用#字符注销，然后回到 /var/cache/apt/lists中删除ubuntu-cn的列表，然后再进行apt-get update，这时您会发现已经没错误提示了，而且采用synaptic也可以正常进行软件的安装与卸载管理了。

8）忘记用户密码，怎么办？

可能您有时会出现忘记系统登录密码的问题。要解决，请参照以下方法：
1. 重启系统，至grub菜单时，选择recovery模式的启动选单；
2. 按字母e, 进入菜单编辑状态，并移动到kernel 行；
3. 加入参数init=/bin/sh或者加入single，回车
4. 此时再按b，进行启动，可见系统启动进入到root模式下
5. 执行mount -o rw,remount / 重新挂载分区
6. cd /home 可以看见用户文件夹名称，这个名称就是您的用户名（假定您的用户文件夹为test, 那么用户名就为test
7. 重新设置test的密码：passwd test
8. 回车输入新的密码，如果忘记了root密码, 那么也是可以通过这个方式修改的密码的：pass root
9. 现在重新启动系统：reboot
大功告成！

9）软件仓库出现严重错误？

您可能遇到在安装某个软件后，软件仓库受到严重损害，即不能安装软件，又不能卸载软件，不能查看以前说 安装的软件包详细列表。这个如何恢复？

方法如下：

首先采用sudo apt-get -f install来修正，一般情况下可以恢复正常。如果还不行，那么就卸载这个造成影响的软件，采用命令：
sudo dpkg –remove –force-remove-reinstreq ［软件包名］
也可以采用sudo dpkg –purge ［软件包名］进行卸载

不过，有时候您可以会遇到以下这样的情况：

dpkg：处理 bioinfoserv-j2re-j2sdk-sunjava6 (–remove)时出错：
子进程·pre-removal script·返回了错误号·1

此时，你可能发现，上面的办法都无法操作。这时，您可以采用以下的办法进行：

首先，采用命令：dpkg -L bioinfoserv-j2re-j2sdk-sunjava6的安装结果，您可以看见这个软件究竟安装到那些目录下了；

然后，采用sudo rm -fr删除这些相应的文件和目录

最后，修改/var/lib/dpkg/status, 找到bioinfoserv-j2re-j2sdk-sunjava6一段，尽数将其删除，然后保存。

此时，您再采用 sudo dpkg –remove –force-remove-reinstreq bioinfoserv-j2re-j2sdk-sunjava，此时会发现：“dpkg - 警告：忽略了删除 bioinfoserv-j2re-j2sdk-sunjava6 的要求，系统没有安装该软件包。”

这样，就可以继续正常进行其他软件的安装了。

10）Gtk-WARNING **: 无法在模块路径中找到主题引擎：“pixmap”？

有时候，由于软件安装过程中的冲突，你可能发现在打开某些程序，会出现“Gtk-WARNING **: 无法在模块路径中找到主题引擎：“pixmap”？”的错误提示，随后程序不能被打开运行。而且鼠标在菜单上的滚动状态将不再可见，一切都失去了生气。

如何解决呢？其实导致这个原因是gtk引擎出现了故障，多数情况下是其他软件包与之冲突后被卸载。因此，解决的办法很简单，安装gtk引擎（gtk2-engines-pixbuf）（本系统中由gtk2-engines-pixbuf_2.16.1-0bioinfoserv3_i386.deb提供，它升级并解决了与libgtk2.0-0_2.12.9-0ubuntu2_i386.deb的冲突情况）即可。

因此，请打开“新立地软件包管理器”搜索gtk2-engines-pixbuf，找到后请确认安装2.16.1-0bioinfoserv3版本。完成该引擎安装后，请您注销系统，然后重新登陆系统，一切都会恢复正常。

11）无法自动挂载移动磁盘设备？

移动磁盘设备无法自动加载，会带来很多不便。那么具体如何解决呢？

移动磁盘设备无法自动加载，其实是因为硬件抽象层hal服务出现了问题，即hal服务没有随机启动，也可能是普通用户没有hal使用权限。为此，可 采用下列方法来修复：

1）安装sysv-rc-conf，并利用它启动DBUS服务（总线消息服务）。

2） 打开“用户和组“管理程序，或者直接在终端下键入命令：sudo users-admin，如下图：

users-admin.png

随即，点击“管理组“，打开组管理界面，如下：

group.png

找到haldaemon，然后，点击“属性“，如下：

hal.png

在组成员中，将您的用户名打上勾，然后确定退出。

如果此设定还不能将自动挂载功能打开，那么，可以在“用户和组“管理程序中，在fuse和disk的组成员中，将您的用户名勾选上。
Prev     Next
开发工具 Home 第19章 创作共享协定